Asrama putra terletak sebelah timur rumah sesepuh Ponpes Al-Jawahir. Dulunya Asrama ini adalah sebuah majelis ta’lim, yaitu Majelis Ta’lim Nurul Hasanah, sekaligus bangunan tertua Ponpes Al-Jawahir, namun sekarang beralih fungsi menjadi asrama putra.
Untuk tahun ajaran baru ini asrama putra sudah berjumlah 4 lokal plus bangunan baru yang terletak di sebelah selatan kompleks PPS Al-Jawahir.
Selain itu, untuk menjaga keamanan dan kenyaman asrama, di sini ada pengasuh sekaligus pengawas khusus untuk mengawasi santri siang dan malamnya.